Vào những ngày cuối đời, Hoàng thân Philip đã bầu bạn với Nữ hoàng trong Lâu đài Windsor. Ông được về với người vợ yêu dấu sau thời gian điều trị tại Bệnh viện King Edward VII ở London.
Sau khi ngưng phụ trách các nhiệm vụ hoàng gia, Hoàng thân Philip tận hưởng cuộc sống về hưu ở Wood Farm ở khu bất động sản Sandringham, cách nơi ở của Nữ hoàng hơn 160 km. Lúc đó, quân chủ nước Anh thường xuyên lưu trú tại Cung điện Buckingham hoặc Windsor.
Hai người đoàn tụ ở Berkshire vào hôm 19/3, sau khi Hoàng thân được trực thăng hộ tống tận nơi để tự cách ly phòng dịch với Nữ hoàng, cùng với khoảng 20 nhân viên. Chia sẻ về sự kiện này, biên tập viên Joe Little của tạp chí Majesty nhận định đây là "cơ hội để họ gắn bó lại với nhau trong những năm cuối đời".
Cặp đôi mẫu mực của hoàng gia được cho là đã dùng bữa cùng nhau mỗi ngày, song vẫn khéo léo dành cho người bạn đời không gian riêng. Tháng 6/2020, Nữ hoàng cùng chụp ảnh với phu quân để chào đón sinh nhật lần thứ 99 của ông. Và dù được sống bên nhau, nhưng họ lại phải xa cách các con cháu của mình do diễn biến phức tạp của đại dịch.
Tuy nhiên, hai người đã có mặt trong lễ cưới bí mật của Công chúa Beatrice với doanh nhân bất động sản Edo Mapelli Mozzi. Đến mùa hè, Nữ hoàng và Hoàng thân Philip gặp lại các thành viên trong gia đình ở Lâu đài Balmoral. Quãng thời gian ngắn ngủi ở Sandringham kết thúc, Nữ hoàng lại bận bịu với công việc ở Windsor, trong khi phu quân của bà vẫn trú tại Norfolk.
Đầu tháng 11, Hoàng thân Philip đã trở lại bên Nữ hoàng chỉ sau chưa đầy một tháng xa cách, ngay trước thềm phong toả lần thứ hai ở nước Anh. Ngày 20/11, cặp đôi tổ chức kỷ niệm 73 năm ngày cưới. Trong ảnh, Nữ hoàng và Hoàng thân cùng nhau ngắm một tấm thiệp mà các hoàng tử, công chúa nhỏ nhà Cambridge tự mình làm để chúc mừng ông bà.
Ngày 9/1, Cung điện Buckingham thông báo Nữ hoàng và Hoàng thân Philip đã được tiêm vaccine phòng COVID-19. Đến hôm 16/2, Công tước xứ Edinburgh nhập viện vì cảm thấy không khỏe. Trong thời gian này, ông đã trải qua một ca phẫu thuật tim.
Hiện chưa có thông tin về đám tang của Hoàng thân Philip, nhưng nhiều khả năng tang lễ sẽ được tổ chức theo nghi thức hoàng gia thay vì tang lễ cấp nhà nước, bởi đó là nguyện vọng của ông.