Theo báo cáo từ Trung tâm Quản lý hạ tầng kỹ thuật thành phố Hà Nội (thuộc Sở Xây dựng Hà Nội), tính đến 23 giờ ngày 7/9, trên địa bàn Hà Nội có 2.215 cây đổ và gãy cành, trong đó, có 1.617 cây đổ, 598 cây gãy cành. Cụ thể, địa bàn thành phố quản lý theo phân cấp có 1.603 cây đổ, 583 cây gãy cành; địa bàn quận quản lý (theo thống kê của Công ty Trách nhiệm hữu hạn Một thành viên Công viên Cây xanh Hà Nội) có 14 cây đổ, 15 cây gãy cành.
Số cây đổ tập trung chủ yếu ở các quận, huyện: Hoàng Mai (327 cây), Hà Đông (128 cây), Hai Bà Trưng (58 cây), Hoàn Kiếm (70 cây), Ba Đình (38 cây), Đống Đa (45 cây), Cầu Giấy (57 cây), Thanh Xuân (38 cây), Long Biên (75 cây), Đại Lộ Thăng Long (220 cây), Thanh Trì (84 cây), đường Võ Chí Công-Võ Nguyên Giáp (41 cây), Đan Phượng (64 cây), Phúc Thọ (43 cây)...
Bão Yagi đổ bộ vào Thủ đô Hà Nội, quần thảo khắp phố phường, xã thôn, khiến nhiều nhà tốc mái, hàng nghìn cây xanh đổ, gãy cành; hàng chục xe máy và ôtô bị hư hỏng; gần 300 bức tường bao bị đổ; nhiều tuyến phố ở Hà Nội ngập sâu trong nước.
Theo thống kê của thành phố Hà Nội, tính đến 19h ngày 7/9, bão đã làm một người tử vong. Đó là nam giới sinh năm 2002, quê Hưng Yên, bị cây đổ đè lên trên đường Trần Duy Hưng, Cầu Giấy. Như vậy tính từ ngày 6/9 tới nay, Thủ đô đã có 3 người tử vong do cây đổ và 7 người bị thương.