Theo đó, hầu hết các hội đồng thi đều có thí sinh bị lệch tổng điểm, trong đó nhiều nhất là THPT Chuyên Thái Bình (223 thí sinh), Quách Đình Bảo (157 thí sinh), Đông Tiền Hải (141 thí sinh)... Chỉ duy nhất 2 trường không bị vấn đề sai lệch điểm số: THPT Đông Hưng Hà, THPT Phụ Dực.
Đoàn thanh tra xác định có 2.769 bài thi tự luận bị sai điểm và 1.589 thí sinh bị sai tổng điểm xét tuyển. Nguyên nhân được đưa ra là do sai sót trong quá trình hồi phách bài thi tự luận khiến 2.769 bài thi đã bị sai điểm.
Cụ thể, hơn 1.400 bài có điểm thấp hơn và gần 1.370 bài thi có điểm cao hơn so với công bố trước đó. Số lượng thí sinh bị sai tổng điểm xét tuyển là 1.589 em.
Sau khi hồi phách lại lần hai, kết quả của một số thí sinh và điểm chuẩn các trường THPT trên địa bàn tỉnh Thái Bình thay đổi như sau:
11 trường THPT đại trà, và 4 lớp chuyên của THPT chuyên Thái Bình đã có sự tăng giảm 0,1 đến 0,4 điểm chuẩn đầu vào. Riêng chuyên Tin học của trường THPT Chuyên Thái Bình tăng cao nhất 0,75 điểm.
Điều này dẫn tới, 252 thí sinh từ trượt thành đỗ, trong đó 15 thí sinh đỗ THPT chuyên Thái Bình.
Đồng thời, có 15 thí sinh Hội đồng thi chuyên sẽ ra khỏi danh sách trúng tuyển vào trường chuyên và 243 thí sinh hội đồng thi trường THPT đại trà từ trúng tuyển trở thành không trúng tuyển nguyện vọng 1.