Theo đó, từ 6h ngày 6/9 đến 6h ngày 21/9 đối với người và phương tiện tham gia giao thông (thuộc đối tượng "được phép mới ra đường") đi từ vùng 1 ra/vào vùng 2 và ngược lại thông qua 6 chốt: cầu Thăng Long, cầu Nhật Tân, cầu Long Biên, cầu Chương Dương, cầu Vĩnh Tuy, cầu Thanh Trì.
Đối với người và phương tiện tham gia giao thông (thuộc đối tượng "được phép mới ra đường") đi từ vùng 1 ra/vào vùng 3 và ngược lại thông qua 16 chốt: cống Liên Mạc, cầu Diễn, cầu Xuân Phương, cầu Ngà, cầu sông Đáy, cầu An Lạc, cầu 72 II, cầu Cù Sơn, cầu Tân Phú, cầu Mai Lĩnh, ngã ba đê Tả Đáy, cầu Thạch Bích, cầu Khê Tang, cầu Qua, cầu Quán Gánh, ngã ba đê Hữu Hồng - trạm bơm Hồng Vân.
Thời gian thực hiện phương án phân luồng, tổ chức giao thông này bắt đầu từ 6 giờ ngày 6/9 đến 6 giờ ngày 21/9/2021.
Người và phương tiện tham gia giao thông lưu thông từ vùng 1 sang vùng 3 và ngược lại không được phép lưu thông qua 30 vị trí chốt cứng do Sở Xây dựng lắp đặt tại điểm giáp ranh giữa các vùng trên các tuyến đường theo chỉ đạo của UBND TP Hà Nội.
Tại 21 chốt kiểm soát bắt đầu hoạt động từ sáng 4/9, Sở Giao thông vận tải bố trí hệ thống biển báo giao thông tại khu vực chốt, bao gồm biển chốt kiểm dịch, biển luồng xanh, biển hạn chế tốc độ, biển báo hướng dẫn giao thông từ xa,...
Để tăng cường công tác an toàn giao thông tại các vị trí chốt trên tuyến đường có tốc độ phương tiện lưu thông cao, Sở bổ sung các hệ thống thiết bị đảm bảo an toàn giao thông như gờ giảm tốc, chóp nón,... và các thiết bị an toàn giao thông khác.
Tại 30 chốt cứng, Sở Giao thông vận tải bố trí hệ thống biển báo giao thông tại khu vực chốt cứng bao gồm biển báo đường cấm, biển hướng dẫn giao thông... kết hợp sơn gờ giảm tốc tại 2 đầu vị trí chốt cứng.
Sở GTVT Hà Nội cũng nêu rõ ranh giới và địa phận các quận huyện, phân vùng. Cụ thể:
Vùng 1 (vùng đỏ - nguy cơ cao), là khu vực đô thị trung tâm thành phố với mật đô dân cư cao, tập trung các cơ quan, doanh nghiệp, cơ sở kinh doanh dịch vụ được xác định là vùng đỏ, tập trung nhiều khu vực, nhiều đối tượng nguy cơ rất cao; phạm vi là toàn bộ địa giới hành chính của 10 quận/huyện (Hoàn Kiếm, Đống Đa, Ba Đình, Hai Bà Trưng, Tây Hồ, Hoàng Mai, Hà Đông, Thanh Xuân, cầu Giấy, Thanh Trì và một phần địa giới hành chính của 5 quận/huyện (Nam Từ Liêm, Bắc Từ Liêm, Hoài Đức, Thường Tín, Thanh Oai).
Vùng 2 (vùng nguy cơ màu cam - phía Bắc, Đông sông Hồng): được phân cách bởi hệ thống Sông Hồng, sông Đuống với vùng 1; phạm vi: toàn bộ địa giới hành chính của 05 quận/huyện: Long Biên, Gia Lâm, Đông Anh, Sóc Sơn, Mê Linh.
Vùng 3 (vùng xanh – nguy cơ thấp ở phía Tây, phía Nam thành phố), Phạm vi: toàn bộ địa giới hành chính của 10 Quận/huyện/thị xã : Sơn Tây, Ba Vì, Phú Thọ, Đan Phượng, Thạch Thất, Quốc Oai, Chương Mỹ, Ứng Hoà, Mỹ Đức, Phú Xuyên) và 1 phần của 5 quận/huyện thuộc phân vùng 1 (Nam Từ Liêm, Băc Từ Liêm, Hoài Đức, Thường Tín, Thanh Oai) chù yếu được chia bởi Sông Đáy, Sông Nhuệ.
